View Gene Prediction
Se hizo la prediccion de genes con el predictor Augustus, arrojando como resultados:
./augustus [parameters] —species=Ustilago SecuenciasRoya.seq
Organismo Modelo | Hits |
Ustilago | 122 |
CoprinusCinerus | 151 |
Saccharomyces | 2718 |
Laccaria_bicolor | 233 |
Magnaporthe_grisea | 80 |
Phanerochaete_chrysosporium | 53 |
Ademas a las 45244 secuencias de roya se le hicieron blastx dando como resultado 5649 secuencias como resultado, a este resultado se le hizo prediccion de genes con el mismo programa augustus con el organinsmo modelo Saccharomyces dando como resultado 855 hits.